职务：课题组长，教授
电话：+86-755-2603-2700
邮箱：wuyd@pkusz.edu.cn
教育背景及工作经历
2016.03-至今 北京大学深圳研究生院院长
2010.09-至今 北京大学化学生物学与生物技术学院讲座教授
2007.07-2010.09 香港科技大学化学系讲座教授
1992.07-2007.06 香港科技大学化学系助理教授\副教授\教授
1988.06-1992.06 洛杉矶大学加州分校化学系高级研究员
1988.01-1988.05 德国埃朗根大学有机化学研究所访问学者
1987.01-1987.12 洛杉矶大学加州分校化学系博士后
1986 匹兹堡大学理论有机化学博士学位
1981 兰州大学物理化学学士学位
奖项及荣誉
2016 洪堡研究奖
2015 中国化学会物理有机化学成就奖
2014 亚太理论与计算化学家协会Fukui Medal
2013 佐治亚大学Robert S. Mulliken讲座
2012 安徽省自然科学奖
2011 香港科学会会员
2009 香港科技大学理学院优秀教育奖
2008 Thomson-Reuters前沿研究奖
2002-2006 国家自然科学基金杰出青年奖
2000 Croucher高级研究奖
1999，2013 国家自然科学奖
1998 王宽诚交流学者奖
2005 中国科学院化学学部院士
研究领域
1、化学反应机理（ Reaction Mechanism ）：通过理论计算与质谱实验等结合的手段，研究过渡金属催化反应的活性与选择性，更好地理解反应的本质规律，进而指导并推动实验的发展。
2、蛋白质分子力场的发展和应用（ Development of Protein Force Fields ）：通过对蛋白质晶体结构的统计分析来发展和优化力场，并通过分子动力学模拟的方法进行蛋白质结构的预测优化及折叠机理等研究。
3、多肽结构与药物设计（ Novel Peptide Structure and Drug Design ）：开展由天然或非天然氨基酸所构成多肽的二级结构的理论计算研究，以期针对重要生物靶点设计环肽类药物
4、WD40蛋白结构与相互作用预测（ Protein-Protein Interaction ）：开展理解WD40结构域上疾病相关突变的致病机理、发展预测疾病相关突变的方法、预测顶面与磷酸化蛋白的结合模式、重复蛋白家族的分类和演化等研究工作。
研究成果
1）化学反应机理： 利用理论计算与实验相结合的方法，针对几类重要化学反应的机理进行了深入研究，包括正离子钌化合物催化的炔烃硅氢化反应、重要的氨基酸配体辅助的C-H活化反应、金属钯催化的腈基导向的间位C-H活化和官能团化反应、Ru(II) 催化的内炔反式硼氢化反应、IBX氧化醇反应等。
2）蛋白质分子力场的发展和应用：我们发展了精确残基特异的蛋白质分子力场RSFF1,RSFF2，并利用新力场实现了对许多小蛋白分子准确的从头折叠模拟。新力场还能用于优化预测的蛋白质结构，以及研究天然无序多肽/蛋白等生物分子体系。
3）多肽结构与药物设计：有特定构象的多肽可以作为重要的化学生物学工具，也是未来药物研发的一个重要方向。我们率先开展了对天然或非天然氨基酸构成的各种多肽的二级结构的理论计算研究，与实验课题组合作设计合成出多种新颖多肽。我们开发了能准确预测环状多肽构象的计算方法，可以结合分子对接等手段针对重要生物靶点设计环肽类药物。
4）蛋白蛋白相互作用：我们发展了一套从蛋白序列预测WD40蛋白结构的方法（WDSP），并建立了数据库。该方法能同时预测出贡献稳定性的氢键网络和参与相互作用的热点氨基酸。在此基础上，我们一方面系统探索了WD40蛋白的演化模式和在整个蛋白互作网络中的拓扑特征，另一方面具体分析了若干WD40蛋白的致病突变在分子结构视角下的可能致病机理。
代表性成果
1. Xinhao Zhang*, Lung Wa Chung*, Yun-Dong Wu*, New Mechanistic Insights on the Selectivity of Transition-Metal-Catalyzed Organic Reactions: The Role of Computational Chemistry. Acc. Chem. Res. 2016, 49 (6), 1302-1310.
2. Gui-Juan Cheng, Xinhao Zhang, Lung Wa Chung, Liping Xu, Yun-Dong Wu*, Computational Organic Chemistry: Bridging Theory and Experiment in Establishing the Mechanisms of Chemical Reactions. J. Am. Chem. Soc. 2015, 137(5), 1706-1725. (Invited Perspective)
3. Yang Wang, Xue-Jia Hu, Xu-Dong Zou, Xian-Hui Wu, Zhi-Qiang Ye*, Yun-Dong Wu*, WDSPdb: A Database for WD40-repeat Proteins. Nucl. Acids. Res. 2015, 43(D1), D339-D344.
4. Shengtao Ding, Li-Juan Song, Yong Wang, Xinhao Zhang *, Lung Wa Chung *, Yun-Dong Wu*, Jianwei Sun*, Highly Regio- and Stereoselective Hydrosilylation of Internal Thioalkynes under Mild Conditions. Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54(19), 5632-5635.
5. Fan Jiang*, Yun-Dong Wu*, Folding of Fourteen Small Proteins with a Residue-Specific Force Field and Replica-Exchange Molecular Dynamics. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136(27), 9536-9539.
6. Gui-Juan Cheng, Yun-Fang Yang, Peng Liu, Ping Chen, Tian-Yu Sun, Gang Li, Xinhao Zhang, K N Houk*, Jin-Quan Yu*, Yun-Dong Wu*, Role of N-Acyl Amino Acid Ligands in Pd(II)-Catalyzed Remote C–H Activation of Tethered Arenes. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136(3), 894-897.
